[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: ثبت نام :: تماس با ما ::
:: دوره 2، شماره 3 - ( پاییز 1391 ) ::
جلد 2 شماره 3 صفحات 218-226 برگشت به فهرست نسخه ها
انگشت نگاری DNA بر مبنای توالی های تکرار شونده ژنومی درگونه های لاکتوباسیل های بومی ایران با استفاده از ,TGT)5-REP-PCR)
فرزانه تفویضی 1، مریم تاج آبادی ابراهیمی
1- ، farzaneh.tafvizi@yahoo.com
چکیده:   (16643 مشاهده)
زمینه و هدف: استفاده از لاکتوباسیل ها به عنوان پروبیوتیک ها، نیازمند به کارگیری روش های دقیق و قابل اطمینان جهت شناسایی باکتری ها در سطح سوش می باشد، زیرا بسیاری از خصوصیات پروبیوتیکی وابسته به سوش می‌باشد. انگشت نگاری DNA بر اساس توالی های تکراری ژنومی با روش REP-PCR به عنوان یک روش تایپینگ قدرتمند، جهت تعیین روابط فیلوژنیک و تاکسونومی باکتری ها مطرح می‌باشد. هدف از این مطالعه، ارزیابی و شناسایی تنوع ژنتیک سوش های لاکتوباسیل های جدا شده از منابع مختلف لبنی و غذایی سنتی در ایران می‌باشد.
مواد و روش ها: ابتدا 20 سوش از محصولات لبنی سنتی از قبیل ماست، پنیر، ترخینه و دوغ ترخینه جداسازی و خالص سازی شدند. واکنش PCR جهت شناسایی ایزوله ها با استفاده از پرایمرهای دجنریت انجام گرفت و محصولات PCR پس از خالص سازی، توالی سنجی شدند. انگشت نگاری DNA با پرایمر GTG)5) جهت ژنوتایپینگ ایزوله ها انجام شد.
نتایج: ایزوله های شناسایی شده تحت عنوان لاکتوباسیلوس کازئی، برویس، پلانتاروم و انتروکوکوس فاسیوم در GenBank ثبت شدند. در پروفایل REP-PCR 20 ایزوله مورد مطالعه، الگوی باندینگ متفاوتی دیده شد. روش گروه بندی UPGMA با استفاده از نرم افزار NTSYS بر روی داده های مولکولی انجام گرفت که با آنالیز PCO نیز تایید گردید. در دندروگرام حاصله سه کلاستر اصلی شکل گرفت.
بحث و نتیجه گیری: روش REP-PCR یک روش کاربردی و بسیار حساس در تمایز ایزوله های مورد مطالعه می‌باشد که با نتایج حاصل از توالی یابی مطابقت کامل دارد. امید است بتوان با تهیه پروفایل های به‌ دست آمده، یک بانک اطلاعاتی دقیق تهیه نمود که جهت غربالگری اولیه و در نهایت تایپینگ باکتری های جدا شده با صرف هزینه کمتر و با سرعت بیشتر به اجرا در آید.
واژه‌های کلیدی: لاکتوباسیلوس، تنوع ژنتیکی، انگشت نگاری GTG)5-PCR)
متن کامل [PDF 1448 kb]   (4456 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: ژنتيك عمومي
دریافت: ۱۳۹۱/۱۲/۱۳ | پذیرش: ۱۳۹۲/۶/۲۳ | انتشار: ۱۳۹۲/۶/۲۳
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

کد امنیتی را در کادر بنویسید >



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Tafvizi F, Tajabadi Ebrahimi M. DNA Fingerprinting Based on Repetitive Sequences of Iranian Indigenous Lactobacilli Species by (GTG)5- REP-PCR. J Fasa Univ Med Sci. 2012; 2 (3) :218-226
URL: http://journal.fums.ac.ir/article-1-127-fa.html
تفویضی فرزانه، تاج آبادی ابراهیمی مریم. انگشت نگاری DNA بر مبنای توالی های تکرار شونده ژنومی درگونه های لاکتوباسیل های بومی ایران با استفاده از ,TGT)5-REP-PCR). مجله دانشگاه علوم پزشکی فسا. 1391; 2 (3) :218-226

URL: http://journal.fums.ac.ir/article-1-127-fa.html

دوره 2، شماره 3 - ( پاییز 1391 ) برگشت به فهرست نسخه ها
Journal of Fasa University of Medical Sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 790 queries by yektaweb 3506