Journal of Advanced Biomedical Sciences
مجله علوم زیست پزشکی پیشرفته
JABS
Medical Sciences
http://jabs.fums.ac.ir
1
admin
2228-5105
2783-1523
8
7
14
8888
13
en
jalali
1399
1
1
gregorian
2020
4
1
10
1
online
1
fulltext
fa
طراحی کیت تشخیصی کلامیدیا تراکوماتیس در زنان علامتدار به روش Real time PCR
Design of Chlamydia Trachomatis Diagnostic Kit in Symptomatic Women Using Real Time PCR
ميكروبیولوژی
Microbiology
پژوهشي
Research
<strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">زمینه و هدف:</span></span></strong> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">کلامیدیا تراکوماتیس یکی از شایعترین علل عفونتهای منتقلِ از راه جنسی در سراسر جهان است. غربالگری زنان برای عفونتهای کلامیدیایی در کشورهای درحالتوسعه به دلیل مؤثر نبودن روشهای تشخیصی در دسترس، بسیار موردتوجه قرارگرفته است. </span></span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">هدف از انجام این تحقیق دستیابی به</span></span> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">روشی است که تشخیص عفونت کلامیدیا تراکوماتیس را در زنان دارای علامت سهولت ببخشد.</span></span>
<div style="text-align: justify;"><strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">مواد و روشها:</span></span></strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> در این مطالعه تعداد 50 نمونه بالینی</span></span> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">(واژینال) از زنان علامتدار جمعآوری شد. پس از استخراج </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">DNA</span></span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">، توالی ژن </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">OMP1</span></span> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">بهعنوان ژن منتخب از بانک ژن استخراج گردید. سپس، با استفاده از نرمافزار </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">Mega6</span></span> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">پرایمرهای اختصاصی طراحی گشت. با نمونههای </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">DNA</span></span> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">استخراجشده </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">PCR</span></span> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">گذاشته شد و صحت پرایمرهای طراحیشده تائید شد. بهمنظور ساخت کنترل مثبت محصول </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">PCR</span></span> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">در وکتور، کلون شد. جهت تعیین حساسیت </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">Real time PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">، رقیقسازی </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">DNA</span></span> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">از کنترل مثبت صورت گرفت و با رقتهای مختلف </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">Real time PCR</span></span> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">گذاشته شد و همچنین جهت تعیین اختصاصیت </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">Real-time PCR</span></span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">DNA</span></span> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">باکتریهای ناحیه واژن استخراج و </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">Real-time PCR</span></span> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">انجام شد</span></span><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">.</span></span><br>
<strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">نتایج:</span></span></strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> در این تحقیق توانستیم بهوسیله تکنیک مولکولی پیشرفته </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">Real-time PCR</span></span> <span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">کیتی طراحی کنیم که دارای 10 پیکوگرم حساسیت و 100 درصد اختصاصیت در تشخیص عفونت کلامیدیایی در زنان علامتدار است.</span></span><br>
<strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">نتیجهگیری:</span></span></strong><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> با پرایمرهای طراحیشده و روش ریل تایم میتوان تشخیص 100 درصد نسبت به عفونتهای کلامیدیا داشت.</span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:9.0pt;"></span></span></div>
<div>
<hr align="left" size="1" width="33%" >
<div><div id="_com_1"></div></div>
</div>
<div style="text-align: justify;"><strong><em>Background & Objective:</em></strong> Chlamydia trachomatis is one of the most common sexually transmitted diseases worldwide. Screening women for Chlamydia trachomatis in developing countries is highly desirable due to the ineffectiveness of the available diagnostic methods. The aim of this study is to design a detection kit for Chlamydia trachomatis in symptomatic women.<br>
<strong><em>Materials & Methods:</em></strong> A total of 50 clinical specimens of symptomatic women were collected. The OMP1 gene sequence was extracted from the gene bank and the primer and probe were designed appropriately by Mega6 software. The extracted DNA was amplified by PCR. In order to provide positive control, PCR product was cloned into Pjet1.2 vector. To determine the sensitivity, DNA dilution was performed. To determine the specificity, DNA of vaginal bacteria was extracted and Real Time PCR was done.<br>
<strong><em>Results:</em></strong> In this study, we designed a kits with 100% specificity and 10pg/ϥl sensitivity in detecting chlamydial infection in symptomatic women<span dir="RTL">.</span><br>
<strong><em>Conclusion:</em></strong> With the use of designed primers and real time, we can detect 100% of chlamydia infections.<br>
</div>
Real time PCR, کلامیدیا تراکوماتیس, OMP1
Real Time PCR, Chlamydia trachomatis, OMP1 gene
2103
2110
http://jabs.fums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1177-2&slc_lang=fa&sid=1
hamideh
rouhani nejad
حمیده
روحانی نژاد
rohaninejhad@gmail.com
100319475328460021202
100319475328460021202
Yes
Malek-Ashtar University of Technology, Tehran, Iran
دانشگاه صنعتی مالک اشتر، تهران، ایران
negar
rahmati
نگار
رحمتی کیان
negar_rk@yahoo.com
100319475328460021203
100319475328460021203
No
Department of Microbioology, Pharmaceutical Sciences Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
گروه میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم دارویی، تهران، ایران
fahimeh
nemati mansor
فهیمه
نعمتی منصور
100319475328460021204
100319475328460021204
No
3. Department of biotechnology, Faculty of Science and Technologies, Pharmaceutical Sciences Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
گروه بیوتکنولوژی، دانشکده علوم و فناوریهای نوین،، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم دارویی، تهران، ایران
darya
amiri
دریا
امیری
amiridarya97@yahoo.com
100319475328460021205
100319475328460021205
No
Malek-Ashtar University of Technology, Tehran, Iran
دانشگاه صنعتی مالک اشتر، تهران، ایران